微生态 用于微生物群落生态学数据挖掘的R包 背景 在微生物群落生态学中，随着高通量测序技术的发展，数据量的增加和复杂性的增加使群落数据的分析和管理面临挑战。 已经为微生物组分析创建了许多R包，例如phyloseq，microbiomeSeq，ampvis2，mare和microbiome。 但是，仍然难以快速有效地执行数据挖掘。 基于此，我们创建了R包microeco。 主要特点 R6类，用于存储和分析数据； 快速，灵活和模块化 分类学丰度分析 维恩图 字母多样性 Beta多样性 微分丰度分析 指标种类分析 环境数据分析 空模型分析 网络分析 功能分析 安装R / RStudio 如果尚未安装R / RStudio，请执行以下操作。 安装 安装 将R放入计算机环境路径中，例如your_directory \ R-4.0.0 \ bin \ x64 打开RStudio ...工具.

使用GWAS摘要数据进行孟德尔随机化 使用GWAS摘要数据执行孟德尔随机化的软件包。 它使用自动获取数据，并使用多种方法进行分析。 您可以使用尝试使用此程序包中的有限功能，但是对于任何严肃的工作，我们强烈建议您使用此R程序包。 完整文档可在此处获取： ： 2020年1月的重大更新 我们对软件包，数据库和参考面板进行了重大更改。 有关更改的完整详细信息，请访问 安装 要安装TwoSampleMR的最新版本，请照常执行： install.packages("devtools") devtools::install_github("MRCIEU/TwoSampleMR") 要更新软件包，只需再次运行install_github("MRCIEU/TwoSampleMR")命令。 我们建议向前使用此新版本，但在有限的时间内，我们将启用向后兼容性，以防您处于分析中间或需要重现旧的分析。 为了

句子 这个存储库包含一个 R 包，它是一个围绕句子 C++ 库的 Rcpp 包装器 句子是一个无监督的分词器，它允许使用字节对编码和 Unigrams 执行文本分词 它基于论文SentencePiece: A simple and languagedependent subword tokenizer and detokenizer for Neural Text Processing [ ] 句子 C++ 代码可从。 这个包目前包含版本 v0.1.84 这个 R 包具有与 R 包类似的功能 特征 R 包允许您 构建字节对编码 (BPE)、Unigram、Char 或 Word 模型 应用模型对文本进行编码 应用模型将 id 解码回文本 下载基于维基百科的预训练句子模型 安装 对于普通用户，从本地 CRAN 镜像install.packages("sentencepiece")安装包

本文是对 R 中精算学专用包 actuar 使用的一个简单教程。actuar 项目开始于 2005 年，在 2006 年 2 月首次提供公开下载，其目的就是将一些常用的精算函数引入 R 系统。目前，提供的函数主要涉及风险理论，损失分布和信度理论。 如题所示，本文是我在学习 actuar 包过程中的学习笔记，主要涉及这个包中一些函数的使用方法和细节，对一些方法的结论也有稍许探讨，因此能简略的地方简略，而讨论的地方可能讲的会比较详细。闲话少提，下面正式开始学习！

MIRES：使用混合效应和收缩率进行贝叶斯测量不变性评估的R包

lidR：用于林业应用的机载LiDAR数据操纵和可视化的R包

WATS是一个R包（> R2.15），其主要目的是对鲸鱼进行声学辅助的标记捕获调查进行基于个人的模拟版本1.0 =适用于R2.15.x版本1.01 =适用于R3.0.3 +有关详细信息，请参见：Peel D，Miller BS，Kelly N，Dawson S，Slooten E和Double MC（2014）对鲸鱼进行声辅助跟踪以进行标记夺回调查的模拟研究。 PloSOne发行中。

Swire4R是一个R软件包，用于在R和Stata之间交换数据。 SWire4R使用SWire将R连接到Stata。 SWire是Stata> = 13的插件，其作用类似于服务器：客户端应用程序可以查询SWire与Stata进行交互。 SWire4R就像Swire的客户端应用程序一样，为用户提供各种基本功能，用于从Stata检索数据并将数据导出到Stata。 SWire4R必须由R编译。有关SWire的更多信息，请访问https://sourceforge.net/projects/swire/

R包，用于声音合成和声学分析。带有帮助，演示等的主页： : github上的源代码： : 执行具有谐波和噪声成分（例如动物的发声或人声）的声音的参数合成。还包括用于频谱分析，音高跟踪，音频分割，自相似矩阵，变形等的工具。 关键功能 从R控制台进行声音合成： soundgen() 声音合成的闪亮应用程序（在浏览器中打开）： soundgen_app() 一个WAV / MP3文件/文件夹进行声学分析： analyze() / analyzeFolder() 用于编辑语调轮廓的闪亮应用程序（在浏览器中打开）： pitch_app() 用于测量共振峰的闪亮应用程序（在浏览器中打开）： formant_app() 测量WAV / MP3文件/文件夹中的音节，暂停和连拍： segment() / segmentFolder 有关更多信息，请参见有关声音合成和声学分析的小插曲： vignet

rmdTemplates：包含Rmarkdown模板集合的R包