这是包含肺腺癌单细胞数据集分析的存储库 入门 克隆 repo 从下面的链接下载 Data_input 文件夹到 repo： ://drive.google.com/drive/folders/1sDzO0WOD4rnGC7QfTKwdcQTx3L36PFwX?usp=sharing 脚本 导入和创建 Seurat 对象 01_Import_data_and_metadata.Rmd ：导入原始数据和元数据。 此 scipt 的输出保存为"S01_Data_and_metadata.RData" 。 02_Create_Seurat_object.Rmd ：从脚本 01 导入 .RData 对象。创建初始 Seurat 对象并执行初始质量控制。 最终输出对象保存为"S02_Main_Seurat_object_filtered.RData" 。 02.1_Create_Seurat_o

事实证明，下一代测序（NGS）是描绘多种癌症分子亚型的强大工具，并且可以揭示整个癌症进展过程中基因组突变的积累。 使用深度测序技术从喉鳞状细胞癌（LSCC）患者获得全基因组microRNA（miRNA）和mRNA表达谱，并通过综合计算方法进行分析。 大量蛋白质编码和非编码基因被检测到差异表达，表明LSCC细胞中的功能转换。 总共检测到127个突变基因与外胚层和表皮发育显着相关。 发现有11种miRNA差异表达，其中包括潜在的癌症抑制miRNA mir-34c，其表达明显下调。 对mRNA和miRNA转录组的综合分析进一步揭示了11个miRNA和138个靶向基因之间的相关动力学，从而形成了对LSCC发育的高度动态的共调节网络响应。