phyloFlash v3.4 由Harald Gruber-Vodicka，Elmar A. Pruesse和Brandon Seah撰写。 phyloFlash是快速重建SSU rRNA并探索Illumina（元）基因组或转录组数据集系统发育组成的管道。 注意版本3更改了一些输入选项，还更改了如何处理基于映射的分类单元（NTU）。 请下载旧版本的v2.0的最新版本（ ）。 没有对数据库设置进行任何更改，因此为v2.0准备的数据库仍可用于v3.0。 请阅读上phyloFlash。 快速开始 通过Conda下载 是一个程序包管理器，如果您还没有依赖关系，它还将安装所需的依赖关系。 phyloFlash通过Conda上的渠道进行分发。 根据，建议同时安装所有软件包，以避免依赖冲突，并创建新的环境而不是安装到基本环境。 # If you haven't set up Biocon

针对FDK算法重建图像异常耗时的问题,提出了一种极坐标反投影快速重建算法。根据三角函数对称性,64幅预处理后的投影数据在反投影过程中同时运算;在极坐标反投影数据映射到笛卡尔坐标时,利用像素位置相关参数的对称性,在不使用查表方法的情况下,使双线性插值的计算量大大减少。实验结果表明,采用这两种措施实现了FDK算法优化,与传统的FDK算法相比,重建速度提高8倍,采用CUDA技术,实现GPU对其加速,速度提高40倍,且均不产生新的误差。

sg平滑matlab代码平滑图信号的结构化采样和快速重建 提供此代码是为了测试以下示例中介绍的采样过程： [1] G. Puy和P.Pérez，“平滑图信号的结构化采样和快速重建”，信息与推理：IMA杂志，2018年。 该代码分为两部分。 Matlab代码允许重现[1]的5.1节中的实验。 python代码允许执行类似于[1]的5.2节中出现的采样和重构的代码。 作者：Gilles Puy 我-子平台matlab /中的Matlab代码 这部分代码允许复制[1]的5.1节中的实验。 先决条件： 下载并安装位于以下位置的图形信号处理工具箱（GSPBox）。 下载并安装Graph Sampling Box（图形采样框），网址为：。 用法： 在matlab中，将目录更改为当前包的子文件夹“ matlab /”。 启动脚本main.m 对于选定的图形和采样分布，此脚本允许计算较低的RIP常数小于0.995的概率作为采样组数的函数。 请参考此脚本中的注释以更改图形，带宽限制或采样分布。 II-子文件夹python /中的Python代码 该部分的代码允许人们进行采样和重构，类似于[1]的5.2节