paradigmshift-源码
PARADIGM-SHIFT：使用通路整合预测功能影响
当前版本
1.0
作者
Sam Ng 和 Joshua M. Stuart
要求
> = 2.7
>= 0.12.0
安装
安装依赖
将范式转换存储库下载到所需位置
在paradigmshift/中运行“make”以生成源文件； 可能还需要下载范例脚本和路径标记脚本存储库（参见和 ）
范式转换、路径标记脚本和范式脚本的源初始化文件（用于 bash 的 init.sh 和用于 csh 的 init.csh）
使用“make”在 examples/ 中的示例数据上运行代码
命令行
paradigmSHIFT.py [options] paradigm_directory analysis_file
paradigm_directory - directory or zip of the paradigm cohort to pe
文件下载
资源详情
[{"title":"（ 21 个子文件 22.89MB ） paradigmshift-源码","children":[{"title":"paradigmshift-master","children":[{"title":"bin","children":[{"title":"significance.R <span style='color:#111;'> 707B </span>","children":null,"spread":false},{"title":"applySHIFT.py <span style='color:#111;'> 37.21KB </span>","children":null,"spread":false},{"title":"gelnet.so <span style='color:#111;'> 12.70KB </span>","children":null,"spread":false},{"title":"paradigmshift.xml <span style='color:#111;'> 789B </span>","children":null,"spread":false},{"title":"summarizeMAF.py <span style='color:#111;'> 4.71KB </span>","children":null,"spread":false},{"title":"mseparation.R <span style='color:#111;'> 907B </span>","children":null,"spread":false},{"title":"gelnet.R <span style='color:#111;'> 2.56KB </span>","children":null,"spread":false},{"title":"median-center.py <span style='color:#111;'> 5.93KB </span>","children":null,"spread":false},{"title":"paradigmSHIFT.py <span style='color:#111;'> 123.23KB </span>","children":null,"spread":false}],"spread":true},{"title":"examples","children":[{"title":"data","children":[{"title":"paradigm","children":[{"title":"config.txt <span style='color:#111;'> 342B </span>","children":null,"spread":false},{"title":"reg.dogma <span style='color:#111;'> 117B </span>","children":null,"spread":false},{"title":"clusterFiles","children":[{"title":"tcgaLU_mRNA.tab <span style='color:#111;'> 55.73MB </span>","children":null,"spread":false},{"title":"tcgaLU_pathway.tab <span style='color:#111;'> 112.23KB </span>","children":null,"spread":false},{"title":"tcgaLU_genome.tab <span style='color:#111;'> 58.02MB </span>","children":null,"spread":false}],"spread":true},{"title":"reg.imap <span style='color:#111;'> 386B </span>","children":null,"spread":false},{"title":"params.txt <span style='color:#111;'> 1.61KB </span>","children":null,"spread":false}],"spread":true},{"title":"mutation_events.tab <span style='color:#111;'> 1.23KB </span>","children":null,"spread":false}],"spread":true},{"title":"Makefile <span style='color:#111;'> 162B </span>","children":null,"spread":false}],"spread":true},{"title":".gitignore <span style='color:#111;'> 33B </span>","children":null,"spread":false},{"title":"Makefile <span style='color:#111;'> 1.45KB </span>","children":null,"spread":false},{"title":"README.md <span style='color:#111;'> 1.94KB </span>","children":null,"spread":false}],"spread":true}],"spread":true}]
评论信息
免责申明
【只为小站】的资源来自网友分享，仅供学习研究，请务必在下载后24小时内给予删除，不得用于其他任何用途，否则后果自负。基于互联网的特殊性，【只为小站】 无法对用户传输的作品、信息、内容的权属或合法性、合规性、真实性、科学性、完整权、有效性等进行实质审查；无论 【只为小站】 经营者是否已进行审查，用户均应自行承担因其传输的作品、信息、内容而可能或已经产生的侵权或权属纠纷等法律责任。
本站所有资源不代表本站的观点或立场，基于网友分享，根据中国法律《信息网络传播权保护条例》第二十二条之规定，若资源存在侵权或相关问题请联系本站客服人员，zhiweidada#qq.com，请把#换成@，本站将给予最大的支持与配合，做到及时反馈和处理。关于更多版权及免责申明参见 版权及免责申明
本站所有资源不代表本站的观点或立场，基于网友分享，根据中国法律《信息网络传播权保护条例》第二十二条之规定，若资源存在侵权或相关问题请联系本站客服人员，zhiweidada#qq.com，请把#换成@，本站将给予最大的支持与配合，做到及时反馈和处理。关于更多版权及免责申明参见 版权及免责申明