scCAEs
ScCAEs：通过卷积自动编码器嵌入和软K均值对单细胞RNA-seq进行深度聚类
ScCAE首先通过卷积自动编码器学习了从原始scRNA-seq到低维特征的非线性映射，然后通过具有KL散度的正则化软Kmeans算法迭代完成了细胞聚类。
建筑学
安装
要使用scCAE，必须确保您的python版本大于3.6。
python
>> > import platform
>> > platform . python_version ()
'3.6.13'
聚酰亚胺直接从PyPI安装所需的软件包。
pip install scipy==1.4.1
pip install scikit_learn==0.22.1
pip install scanpy==1.4.6
pip install python-igraph==0.8.2
我们建议使用conda安装theano：
conda inst
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