结直肠癌TCGA+GEO数据库临床资料 实时更新TCGA和GEO中结直肠癌的数据
2021-05-22 13:22:18 530KB TCGA  GEO
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TCGA可变剪切矩阵
2021-05-14 09:05:48 25.78MB TCGA 可变剪切
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自己编写程序,对TCGA的临床信息进行整理和提取,便于做生存分析
2021-05-04 18:03:33 163KB TCGA 临床数据 生存分析
PanClassif:用于癌癌分类的机器学习分类器管道 这是一个完整的机器学习管道软件包,可用于TCGA癌症RNA-seq基因计数数据。 数据预购 使用TCGA2STAT下载TCGA癌症和正常样本 使用knn-smoothing对上述收集的数据进行平滑处理( ) 功能 featSelect(homepath,cancerpath,normalpath,k) 参量 homepath:(str)您要保存所有生成的文件和文件夹的路径。 癌变路径:(str) 所有癌症的癌症基因表达矩阵所处的路径。 normalpath:(str) 所有癌症的正常基因表达矩阵所处的路径。 k:(int)每个癌症要选择的最重要基因的数量。 (默认值:k = 5)您不能将k设置为小于5 dataProcess(homepath,names,cancerpath,smoothed_cancer,smoothed
2021-03-09 19:05:34 200KB Python
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使用Python递归解析从TCGA下载的metadata.cart.json文件
2021-02-24 16:23:00 6KB Python JSON TCGA
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该工具可以简化TCGA数据库的下载步骤,合并TCGA数据库中下载的文件
2019-12-21 20:57:21 14.63MB 下载
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