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联系方式 用于简单蛋白质残基-残基接触图绘制的 Python 包。 。 安装 ContactVis 可以从 PyPi 安装： pip -U ContactVis 或者 easy_install -U ContactVis 用法 在Python内： from contactvis import plot_contact_map plot_contact_map.plot_map(fasta_filename, contact_filename, factor, c2_filename='', psipred_filename='', pdb_filename='', is_heavy=False, chain='', sep=',', outfilename='') 终端： [--psipred_horiz PSIPRED_HORIZ]

蛋白质接触矩阵是3D蛋白质结构中氨基酸残基之间距离的2D表示。 蛋白质接触图生成器（PCMGen）是一种命令行工具，它将蛋白质3D结构（PDB格式的文件）作为输入，并计算两条链（来自单个或两个不同的蛋白质）之间的接触距离。 这些矩阵文件可以使用其他可视化工具/程序（如R-heatmaps）进一步可视化为Contact Maps。 接触图可用于理解蛋白质：1.二级结构2.构象排列3.表面相互作用

利用生物质谱仪器进行蛋白鉴定和定量分析时，往往要获得一个蛋白的理论酶切肽段，该程序提供了一个对蛋白进行胰酶切的程序，规则（R、K切，RP、KP不切）。程序需要输入一个FASTA格式的蛋白序列文件（压缩包中是文件InternalStandards.fasta），输出文件可以自己设定，必须保证有输入和输出文件，程序才能运行。另外，程序还提供漏切次数和肽段长度选项

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蛋白质设计及蛋白质网络模型的研究