pyHRV是一个开放源代码的Python工具箱,可从心电图(ECG),SpO2,血容量脉搏(BVP)或其他带有心率指示器的信号中计算出最新的心率变异性(HRV)参数。 借助pyHRV,我们旨在为HRV专门的教育,研究和应用程序开发提供一个用户友好且通用的Python工具箱。 它提供了可理解的源代码,以帮助初学者了解HRV参数计算的基础,同时为开发人员提供最重要的HRV分析功能,并为研究人员提供结果的质量出版物。 入门 安装 可以使用pip工具安装此工具箱(适用于Python 2和3): pip install pyhrv 依赖关系: | | | | | 光谱 文档和教程 详细的pyHRV文档可在ReadTheDocs上找到: pyHRV API参考 其他教程可以在这里找到: pyHRV快速入门指南 教程:从ECG采集到使用pyHRV进行HRV分析 教程:使用pyHR
2021-09-13 21:50:36 20.86MB python-toolbox ecg-signal hrv heart-rate-variability
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岩土参数统计器,可计算变异系数。标准差,标准值
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心率变异性分析 hrvanalysis是用于对RR间隔进行心率变异性分析的Python模块,建立在SciPy,AstroPy,Nolds和NumPy的基础上,并根据GPLv3许可进行分发。 该库的开发于2018年7月开始,属于研发团队的项目的一部分,由Robin Champseix维护。 完整文档: : 网址: : GitHub : : 版本:1.0.4 安装/先决条件 用户安装 安装hrv-analysis的最简单方法是使用pip : $ pip install hrv-analysis 您还可以克隆存储库: $ git clone https://github.com/Aura-healthcare/hrv-analysis.git $ python setup.py install 依存关系 hrvanalysis需要以下条件: Python(> =
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行业分类-物理装置-一种基于二代测序数据的反转相关复杂变异检测方法.zip
NGS_DNA管道 手动的 在上找到安装和使用手册 前处理 在管道的第一个预处理步骤中,将PhiX读段插入每个样本中,以在数据集中创建控件SNP。 随后,检查Illumina编码,并使用FastQC 1计算QC度量。 与参考基因组比对 Burrows-Wheeler Aligner(BWA) 2的bwa-mem命令用于将序列数据与参考基因组进行比对,从而生成SAM(序列比对图)文件。 SAM文件中的读取内容用Sambamba 3排序,从而生成了排序的BAM文件。 在测序过程中使用多个泳道时,使用Sambamba将所有泳道BAM合并为样本BAM。 (合并的)BAM文件使用Sambamba标记为同一读取对的重复项。 变种发现 GATK 4 HaplotypeCaller使用贝叶斯可能性模型针对基因组的每个位置估算比对中最可能的基因型和等位基因频率,而与在该位点是否检测到变体无关。 以后可以
2021-08-29 22:07:10 55.21MB Shell
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粒子群算法优化bp神经网络,预测代码 确保上传的内容合法合规,涉及侵权内容将会被移除,详见CSDN资源共享规范。
2021-08-25 18:13:26 1KB 粒子群算法
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DeepVariant - Google开源深度学习模型,将基因组中的识别变异任务转换为图像分类问题的基因组学工具
2021-08-22 15:14:27 26.77MB Python开发-机器学习
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基于变异粒子群的聚类挖掘.pdf
2021-08-20 14:12:57 274KB 聚类 算法 数据结构 参考文献
matlab有些代码不运行Geostats-matlab 该存储库包含用于地统计分析的一组功能和测试脚本,包括变异函数图绘制和分析,克里金法,随机场模拟和数据的条件模拟。 分析的主要功能是geostatm.m。 此函数接受协方差模型(可以是高斯,指数,球面,矩阵,块金或幂定律),以及初始参数猜测和要插值的数据。 该程序包仍在开发中,我主要只对2D数据集进行了测试,而对1D进行了一些有限的测试。 依存关系 variogramfit.m和randomfield.m是可与geostatm一起使用的两个可选函数。 randomfield是由Qiqi Wang()和Paul G. Constantine()开发的。 它用于生成具有给定协方差结构的随机字段,也可以用于条件仿真,尽管目前我不使用它们的代码来执行此操作。 Variogramfit是Wolfgang Schwanghart的lsqcurvefit的替代方法,我默认使用它来估计理论变异函数的参数。 以我的经验,lsqcurvefit通常效果更好,但根据情况的不同,差异可能很小。 这两个代码都可以从Matlab文件Exchange中获得。
2021-08-14 17:19:08 28KB 系统开源
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